2.Linux

1) Table of Contents

我们从一些 Linux 的基本操作开始我们的学习。本节包括两个部分
  • Basic Command: 一些基本命令的介绍和相关阅读推荐,供大家课前预习了解。
  • Practice Guide: 一个简单的上机指南供大家练习。
  • Linux Bash: 一个快速入门bash的教程和相关阅读推荐。

2) Files Needed

Method 1: use docker

docker images的下载链接如附表所示,加载完我们提供的image后,文件都已经准备好了,可以这样查看:
cd /home/test/linux
ls
本教程docker使用方式:
  • 1) 运行容器: docker exec -it bioinfo_tsinghua bash
  • 2) 进行Linux系统的相关操作
  • 3) 退出容器:exit

Method 2: directly download files needed

  • 如果不使用docker,也可以直接从该链接Files needed by this Tutorial中的清华云Bioinformatics Tutorial / Files路径下的相应文件夹中下载所需要的文件。

3) Recommended Videos (link)

  • Part I: 2.1 How to use Linux - ZJL
  • Part I: 2.1 How to use Vim
  • Part I: 2.2 Programming in Linux - LXF
  • Part I: 2.3 bash - Shell脚本编程案例 (20min)
  • Part I: 2.3 bash - Shell脚本编程基础 (1hr)
对零基础的同学可以先学习一下以下两个视频:
  • 2.1 Linux小白Shell入门
  • 2.1 Linux Editor - nano