1.Setup
工欲善其事，必先利其器
- 由于历史原因，就生物信息数据分析而言，linux操作系统的软件生态比windows好得多，有很多生物信息的工具只支持linux系统。所以熟悉linux操作系统的使用对于学习生物信息是很有必要的。
- 除了需要linux环境，在我们的学习中还会遇到各种软件的依赖。鉴于在自己的笔记本上使用linux环境的同学不多，为了给大家提供linux的操作环境，并且节约一些软件安装的时间，我们提供了两种解决方案:
A hackable text editor for the 21st century.
"It is hard to learn, but incredible to use. "
Vim 的更重要的应用场景是在Linux Terminal中的使用（Linux系统自带 Vim 无需单独安装），它不依赖鼠标，完全靠键盘就可以操作各种编辑，主要就是模式之间的切换，如下图所示：
Vim 模式切换
You can learn vim progressively, and it will be your last text editor. There isn’t any better text editor that I know of. It is hard to learn, but incredible to use.I suggest you teach yourself Vim in 4 steps:
- 1.在Windows或者MacOS下安装和练习使用Atom和Vim，可以使用鼠标提高工作效率。
- 2.安装和学习使用Docker (Install Docker, load an image and create a container)。利用 Mac 和 Windows 系统自带的录屏工具录制一个不超过15秒的使用录屏（示例：I.1 Doker/1.3 Use and exit the container 中的动画）。请用自己的姓名的拼音命名 container，例如 zhangsan_linux，否则判零分。
- 3.在Docker的Linux Terminal里面打开 Vim，练习完全通过键盘来完成各种编辑操作。
注: 作业提交一个不超过15秒的录屏文件即可，可以是 mp4, mov 或者 gif 格式。
Craig Venter & Francis Collins 人类基因组计划竞赛的故事
2000年6月26日，美国总统Clinton等六国领导人共同宣布人类基因组计划的草图完成。在新闻发布会现场，站在Clinton身侧的两位“科研明星”分别是人类基因组计划的官方领导人Collins和Celera 公司的领导人Venter。
此后，这两个人还共同出现在《时代》杂志的封面上。作为一个民间团体，并且是一个饱受争议的民间团体的领导人，Venter能够获得和政府资助的Collins平起平坐的机会。不论围绕在他身上的争议如何，正是由于他引发的这场“科研竞赛”，使原本预计 15年才能完成的计划，整整提前3年即告完成。
Francis Collins和Craig Venter两位杰出科学家身上的标签并不仅 限于“人类基因组计划”。
Craig Venter
Craig Venter是一位极富有商业头脑的“科学狂人”，在Celera 公司之后，他又先后创建了合成基因组Synthetic Genomics 公司、J. Craig Venter 研究院和Human Longevity公司。他带领团队带领团队成功地把一个合成的基因组转移到了细胞里，这是全球第一个。 如今他也正在向延长人类寿命发出挑战。
Craig Venter 这位科学天才并不是一路优秀着长大的。他高中时期学习成绩并不理想，经常考C和D。据他自己所述，对他人生改变最大的是越南战争。
20岁的时候，他在越战中的海军医院服役，负责对从前线回来的受伤战士进行分组，他能决定哪些可以得到优先治疗。战争是残酷的，生命是如此脆弱，这种决定这谁能活谁会死的事情却让他承受了很大的心理压力，甚至多次想要自杀来逃避……在最艰苦、最恶劣的环境下，他对医学和科学开始产生兴趣。战场上生命如此廉价，这个二十岁的少年开始思考生命的意义，在越战的硝烟与血腥中他树立了自己人生的第一个小目标：如果活着离开越南就去研究生死。
经历了战争的九死一生之后， Craig Venter，这个当初高中都差点无法毕业的小伙子居然用6年是将拿到了生理和药理学的双料博士学位
Francis Collins
Francis Collins是优秀的医学-遗传学家，第一个受到两任美国总统（奥巴马和唐纳德川普）直接任命的美国国立卫生研究院院长（NIH director），领导美国精准医疗计划，向人类健康发出新挑战。
Francis Collins是美国国立卫生研究院院长（NIH director），领导人类基因组计划，并发现了多种疾病基因。
去年The David Rubenstein Show采访了 Francis Collins 。Rubenstein问他当年领导人类基因组计划的意义，他说到这些年癌症治疗的变化，个体化用药（personalized medicine），还举 了个人例子。他做了基因测序，发现自己糖尿病的风险比普通人高许多，但父母都没有糖尿病，于是改变饮食增加运动，减了35磅体重，变成了另一个人。
Francis Collins是一位低调的科学家，但是他的两大爱好众所周知。他非常喜爱摇滚音乐，他和NIH同事组织了一个摇滚乐队，将生物研究的日常写进他们的歌词里面。摩托骑行是他的另一大爱好，据他自己所述，骑摩托车对他而言是一种享受生命的感觉，这种感觉难以用别的方式来代替。
Last modified 5mo ago